什么区分大学及其学院？
我以我了解的为例，比如清华、北大、人大这些学校，他们在2000年以前都是分校或者分院，如清华大学深圳研究生院（原清华大学深圳分部）。这种模式是跟民国时期院校格局相一致的，当时清华大学和北京大学也是分为多个校区的。这种情况下的院和校其实没什么区别：校区不过是学校的一个部分罢了。
但是到了21世纪初，国家要创建世界一流大学了，这时问题就来了——什么是“一”？怎么才算“流”呢？按照民国时期的规模去建设一所高校显然达不到要求的，因此很多学校都选择了合并，扩大规模以提高在学校排行中的位次（因为评价体系中学校规模也是一个指标）。但问题是有些学校你没法合啊！比如说清华和北大，如果两所学校的校长坐在一起商量一下，把两个学校合成一个学校，这是可以接受的；但如果你让北大校长带着人直接赶到清华，说我们北大就要在清华的基础上建校，这肯定不行……于是乎，原本在民国时期隶属于某一学校的某些院系就可能脱离原来的母体独立出来，成为新的学校（注意：只是成为“新”的学校而不是建立“新”的大学），而原来学校的一些其它院系可能也会加入这个新的学校，这样，一所新的学校就诞生了。
当然，也有不走这种模式的，比如中国科技大学，它本来就是一所以理工科为主的大学，为了配合国家科技兴国战略，中科大放弃了原有的综合性大学的身份，集中一切力量发展自己的优势学科，于是理工大的名号更胜往昔。这种情况下，学校整体水平有了很大的提高，也迅速上升了学校在排行榜上的位置，从以前的一本到现在的顶尖985，可以说和这种舍弃杂而精的发展模式有着很大的关系。